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生物化学与分子生物学技术服务

       分子生物学理论的种种突破无一不与分子生物学研究技术的创建和发展息息相关,可以说两者是科学与技术相互促进的最好例证。分子生物学技术的产生得益于生物化学与分子生物学、遗传学、免疫学和发育生物学等领域的许多重大发现,它的诞生为这些领域的研究工作提供了新的研究工作和手段,利用分子生物学技术在这些领域中获得的新发现又使这些技术自身不断地得以丰富和发展。

      为此,本室建立了技术信息服务平台。为校内、外科研院所的科研人员提供下以下两类服务:

一、生物信息学高级数据挖掘服务

       提供高质量低成本,方便快捷的高级生物信息学服务,包括高通量生物学数据(GEO来源文件)分析,基因的功能注释和分类,蛋白质相互作用网络构建,根据网络的拓扑性质,挖掘网络重要节点,以及蛋白质及其突变体的空间结构分析与模拟。 

服务条件和内容:

       客户需提供数据及相关信息,我们分析整理并提供一份标准化的分析报告。报告将详细列出所用软件、参数、关键概念的注释、及图、表说明。(客户对报告有疑问可与报告负责人直接联系)

      1. 基于GEO芯片结果(CEL文件)或excel文件的基因差异表达重分析,选择所需比对(两组)的芯片结果中差异程度最明显的至少200个基因作为分析对象.

  • 根据基因表达的上、下调情况给出芯片结果的差异统计表;
  • 给出差异表达基因的功能分类表;
  • 给出差异表达基因的功能注释或信号通路表
  • 给出差异表达基因的功能注释或信号通路的聚类分析表
  • 对差异表达基因进行蛋白质相互作用网络分析;
  • 任选5个感兴趣的基因差异表达组图

   2. 蛋白质空间结构分析与模拟

服务方式:

     1. 合作关系。进行数据处理,与生物信息学相关的内容分析,以及后续的实验设计。发表文章时,署名以本单位为共同第一作者或共同通讯作者者,半价;

     2. 信息服务。可以按下列标准收费(常规需要10个工作日,加急时间可减半)

  • 差异表达基因分析的每对CEL文件或样品3000元(在项目报告中完成5表1图);
  •  蛋白质空间结构分析与模拟5000元/300aa(共给出至少六张图,也可按具体项目计费;计费以模拟出的结构为准,不到300aa按300aa计,不到600aa按600aa计,以此类推;不能模拟结构的序列不收费);
  •  加急分析价格加倍;
  •  校内服务按上面收费标准8折

 

服务项目明细

费用

基因差异表达重分析

          每对CEL文件或样品3000元

蛋白质特定序列位点的保守性分析

           免费

蛋白质空间结构的模拟及多角度(立体)显示

           1000元/300aa,限张两图

突变位点的空间结构显示及其与未突变蛋白结构的叠加比较

           1000元/图

蛋白质表面分子的预测及其表面电荷分布状况模拟

             500元/图

蛋白质相互作用,蛋白与核酸相互作用的空间结构解析

            2000元/图

功能蛋白质分子的点突变设计

            1000元/点

 

二、技术类服务

        1、流式细胞学检测:流式细胞仪(flow cytometry,FCM)是集激光技术、电子技术、光电测量技术、计算机技术以及细胞荧光技术、单克隆抗体技术为一体的新型高科技仪器,具有灵敏度高、重复性好、特异性强、方法灵活、分析速度快等优点。可进行的检测项目有:DNA倍体含量测定;研究细胞周期或DNA倍体与细胞表面受体及抗原表达的关系;定量分析细胞周期细胞凋亡研究等。

        2、蛋白纯化:本室拥有一台蛋白纯化仪,购自瑞典安玛西亚公司,可以得到高度纯化并具有生物活性的目的蛋白,具有高速,高载量和组份收集的优点,是进行蛋白质结构与功能研究的基础和关键仪器。

        3、实时定量PCR:实时定量PCR灵敏度高应用广泛,包括基于相对定量分析的基因表达分析,以标准曲线为基础的病原体绝对定量分析,定性的PCR扩增后核酸序列的SNP基因型分析,以及以阳性内对照为基础的阳性/阴性结果判定。

       4、蛋白质检测:通过蛋白免疫印迹的方法,利用红外荧光扫描仪检测蛋白质的表达。

 

技术服务负责人:路凡

信息服务负责人:王立锋

联系人:王丽亚     

电话: 84774537    

Email: lufan@fmmu.edu.cn

Email: Wanglf@fmmu.edu.cn

 

 

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